Интересно наступил на грабли «почищенного вручную кэша». Перестали устанавливаться модули в студии, выпадая с сообщение об ошибке установки модуля:



Устанавливаем плагин firebug для firefox, пытаемся установить модуль снова и видим в окне firebug вот что:

ZIP Error(11): Status(0): Arhive(cache//upload/upgrades/module/Med2012_03_24_152849.zip): Directory(/var/www/sugar/cache/upgrades/temp/u7grIM)

Суть проблемы вот в чем — в кеше должен оставаться zip архив с текущей версией самописного модуля. Восстановил из бэкапа и все заработало. Вот такие дела.