Отличный мануал по настройке для движка LiveStreet:

http://livestreet.ru/blog/dev_documentation/366.html

На Debian Lenny отличаются пути установки Sphinx:

Создаем индексы (я перед этим создал соответствующие директории):

/usr/local/bin/indexer --all

В /etc/crontab добавляем индексацию топиков и комментариев:

12 */3 * * * root /usr/local/bin/indexer --rotate topicsIndex
*/50 * * * * root /usr/local/bin/indexer --rotate commentsIndex

(означает индексацию топиков каждые 3 часа с запуском процесса на 12ой минуте часа и индексацию комментариев каждые 50 минут).

Запускаем командой:

/usr/local/bin/searchd --config /usr/local/etc/sphinx.conf

Эту же команду добавляем в /etc/rc.local.